短串联重复序列(STRs)是由1-6 bp重复基序组成的多态性DNA序列，广泛分布于真核生物基因组中。近年来바카라 가입 머니表明，STRs不仅在基因表达调控和表型变异中发挥重要作用，还与多种人类遗传疾病密切相关。例如，2023年12月，JGG报道了长非编码RNA的CGG重复扩增导致眼咽远端型肌病。在植物바카라 가입 머니领域，STRs主要被用于品种鉴定和群体遗传定位的分子标记，但其在植物群体基因组中的具体特征和功能仍有待深入探索。近日，华南农业大学刘耀光/谢先荣团队与华中农业大学谢为博团队合作在Journal of Genetics and Genomics在线发表题为“Genome-wide profiling of polymorphic short tandem repeats and their influence on gene expression and trait variation in diverse rice populations”的바카라 가입 머니论文。该바카라 가입 머니构建了全面的水稻STRs变异图谱，系统分析了其在基因表达调控中的作用，并通过实验验证了特定STR对基因表达和农艺性状的调控作用，为水稻遗传改良提供了新靶点和资源。

该바카라 가입 머니基于4,726份水稻材料的重测序数据，构建了包含137,629个多态性STRs的全基因组图谱，揭示了STRs在水稻基因组中的分布与特征。바카라 가입 머니人员采用机器学习方法，预测了STRs对染色质可及性的潜在影响。通过对叶片转录组数据与STRs基因型进行联合分析，鉴定到44,672个与邻近基因表达关联的STRs (eSTRs)，并且这些eSTRs在基因转录调控区域显著富集。进一步바카라 가입 머니发现，编辑OsFD1启动子中的(ACT)7 STR能够调控OsFD1基因表达，进而影响水稻抽穗期和产量，说明通过编辑STRs能够实现对水稻农艺性状的微调，为利用STRs进行水稻遗传改良提供了新思路和资源。

此外，바카라 가입 머니团队将STRs变异图谱整合到了RiceVarMap v2.0数据库中(

通过编辑OsFD1启动子的STR微调基因表达和表型

综上所述，该바카라 가입 머니构建了水稻全基因组STRs的变异图谱，揭示了STRs在基因组内的分布特征和群体中的变异模式，바카라 가입 머니了其对转录调控的影响。通过编辑OsFD1启动子中的STR，展示了STR变异在精准育种中的应用潜力，为理解STRs在植物基因组中的作用提供了新见解。

作者简介

华南农业大学博士바카라 가입 머니生谭习羽为该论文第一作者。华南农业大学谢先荣副바카라 가입 머니员、刘耀光教授及华中农业大学谢为博教授为共同通讯作者。中国农业科学院作物科学바카라 가입 머니所徐建龙바카라 가입 머니员为该바카라 가입 머니提供了重要帮助。相关工作得到国家自然科学基金和广东省基础与应用基础바카라 가입 머니重大项目资助。

转载自BioArt植物微信公众号