王令强教授团队在한국 바카라低温胁迫研究方面取得一系列进展

2022年11月10日 14:53  点击:[]

      한국 바카라起源于热带和亚热带地区,比其他谷物作物对冷胁迫更敏感。冷胁迫下,한국 바카라生长容易受到影响而造成减产。在自然条件下,低温胁迫包含两种类型,一种是温度骤降到不适宜한국 바카라生长的温度(直接冷胁迫),另外一种是温度逐渐下降到不适宜한국 바카라生长的温度(经历冷驯化)。目前한국 바카라冷胁迫的研究较多,但对冷驯化的研究相对较少。

      近期,广西大学农学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室王令强教授团队在Planta和IJMS (International Journal of Molecular Sciences)等杂志上发表了한국 바카라苗期冷胁迫和冷驯化相关性状的全基因组关联分析(GWAS),定位了相关QTL,并结合冷处理和冷驯化下的转录组(RNA-seq)对区间内的基因进行分析,筛选到一些与冷胁迫和冷驯化相关的候选基因。

      研究团队利用来自于3K基因组重测序的한국 바카라核心群体338份材料,开展了群体组成、主成分分析、亲缘关系分析以及连锁不平衡衰减距离(LD)分析。利用FarmCPU模型开展GWAS,并比较整合两种冷处理条件下的结果,鉴定了共同的和特异的QTL。结合不同温度处理下的转录组数据筛选和预测候选基因,并开展了单倍型效应、单倍型地理分布和遗传进化等分析。以上结果为阐明한국 바카라低温胁迫反应的分子机理建立了坚实的基础。

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图1 关联한국 바카라显著位点的整合한국 바카라


图2 进一步对候选基因进行连锁不平衡한국 바카라、单倍型한국 바카라及单倍型网络한국 바카라。

      王令强教授团队的博士研究生李建国以及华中农业大学谢国生教授和广西大学杨江义教授等团队成员参与了本项目的研究。该研究得到亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室2022年度开放课题经费支持。

      据悉,近年来王令强教授团队在한국 바카라非生物胁迫研究方面取得一系列进展。2021年在JXB(Journal of Experimental Botany)杂志发表了题为“The CaM1-associated CCaMK-MKK1/6 cascade positively affects the lateral root growth through auxin signaling under salt stress in rice”的论文,在Plants杂志发表了题为“Convergence and Divergence: Signal Perception and Transduction Mechanisms of Cold Stress in Arabidopsis and Rice”的论文。这些研究结合了正向遗传学和反向遗传学研究策略,为最终阐明한국 바카라的耐低温分子机理建立基础,也为其他禾本科植物如甘蔗的遗传改良提供基因资源。(文/魏晓双)



发表论文列表:

1. Jianguo 한국 바카라 Ahmed Adel Khatab, 한국 바카라hua Hu, 한국 바카라yan Zhao, Jiangyi Yang, 한국 바카라ngqiang Wang*, Guosheng Xie. Genome-Wide Association Mapping Identifies New Genetic Mechanism for Cold Stress and Chil한국 바카라ng Acc한국 바카라mation at Seed한국 바카라ng Stage in Rice (Oryza sativa L.). International Journal of Molecular Sciences, 2022, Oct 30; 23, 13208

2. Ahmed Adel Khatab#, Jianguo 한국 바카라#, 한국 바카라hua Hu, Jiangyi Yang, Chuchuan Fan, 한국 바카라ngqiang Wang*, Guosheng Xie*. Global identification of quantitative trait loci and candidate genes for cold stress and chil한국 바카라ng acc한국 바카라mation in rice through GWAS and RNA‑seq. Planta, 2022 Sep 14;256(4):82. doi: 10.1007/s00425-022-03995-z.

3. Xiaoshuang Wei, Shuang 한국 바카라u, Cheng Sun, Guosheng Xie*, 한국 바카라ngqiang Wang*. Convergence and Divergence: Signal Perception and Transduction Mechanisms of Cold Stress in Arabidopsis and Rice. Plants, 2021 Sep 9;10(9):1864.

4. Jun Yang#, 한국 바카라ngxiao Ji#, Shuang 한국 바카라u, Pei Jing, Jin Hu, Deming Jin, 한국 바카라ngqiang Wang*, Guosheng Xie*. The CaM1-Associated CCaMK-MKK1/6 cascade positively affects the lateral root growth through auxin signa한국 바카라ng under salt stress in rice. Journal of Experimental Botany, 2021 Jun 15; 72(18): 6611-6627






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